一、基本信息
王洋，博士，副教授，硕士生导师
电子邮件：yangwang@hubu.edu.cn
研究领域：
l 肿瘤医学大数据组学分析及分子标志物的鉴定：结合生物信息学手段，利用混池转录组测序、单细胞转录组测序数据，研究肿瘤及其他复杂疾病的基因调控、选择性剪接异常，挖掘潜在的预后生物标志物，并探索肿瘤免疫微环境和异质性的分子机制。
l 人工智能驱动的生物药物设计与优化：基于深度学习与机器学习算法，优化蛋白质-抗体、蛋白质-小肽、蛋白质-配体等相互作用的预测与分子对接，提升生物药物设计的精准度和研发效率。
l 酶的优化与改造：利用AI算法对酶进行结构优化与功能改造，探索新的催化机制，增强酶的稳定性、活性和底物特异性，推动酶工程在工业和环保领域的应用。
二、教育背景
2014.09-2018.12 哈尔滨工程大学智能学院，生物信息学专业，博士研究生
2015.08-2018.07 美国普渡大学医学院，生物信息学专业，联合培养博士
2011.09–2014.06 东北农业大学必赢集团网站，生物信息学专业，硕士研究生
2006.09–2011.06 哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，学士
三、工作经历
2021.07-至今 必赢唯一官方网站，副教授
2018.12–2021.6 必赢唯一官方网站，博士后
四、主持科研项目
1. 基于单细胞转录组的脑胶质瘤功能异质性研究，必赢唯一官方网站，2018.12-2020.12，主持
2. 肾透明细胞细胞癌肿瘤免疫微环境解析，湖北省自然科学基金青年基金，2022.01–2024.01，主持
3. 恶性肿瘤中lncRNA遗传变异驱动的生物特征识别，必赢唯一官方网站，2021.12-2022.12，主持
4. 基于多组学数据的阿尔兹海默症发病机制研究，武汉市科学技术局，2022.09-2024.06，主持
五、代表性论文（#第一作者; *通讯作者）
1. Li J, Qin L, Xu K, Jie L, Anren X, Yunlong Q, Xiaolu F, Peng W, Yang W*. Celllular heterogeneity and inflammatory profiles in gliomas: single-cell transcriptomic insights. Brain-X. 2025;3:e70013.
2. Zhang S, Li M, Zeng J, Zhou S, Yue F, Chen Z, Ma L, Wang Y*, Wang F*, Luo J*. Somatostatin receptor-targeted polymeric nanoplatform for efficient CRISPR/Cas9 gene editing to enhance synergistic hepatocellular carcinoma therapy. J Nanobiotechnology. 2025 Feb 20;23(1):127. doi: 10.1186/s12951-025-03214-3. PMID: 39979929; PMCID: PMC11844079.
3. Xu K, Li J, Qin L, Liu J, Yang H, Dou G, Ma L, Dong Y, Wang Y*. Decoding ecosystem heterogeneity and transcriptional regulation characteristics of multi-subtype renal cell carcinoma. Heliyon. 2024 Jun 25;10(13):e33196. doi: 10.1016/j.heliyon.2024.e33196. PMID: 39044973; PMCID: PMC11263639.
4. Wang L, Wang D, Zeng X, Zhang Q, Wu H, Liu J, Wang Y*, Liu G*, Pan Y*. Exploration of spatial heterogeneity of tumor microenvironment in nasopharyngeal carcinoma via transcriptional digital spatial profiling. Int J Biol Sci. 2023 Apr 17;19(7):2256-2269. doi: 10.7150/ijbs.74653. PMID: 37151882; PMCID: PMC10158028.
5. Li S#, Wang Y#, Sun R, Franceschi D, Pan H, Wei C, Ogbuehi AC, Lethaus B, Savkovic V, Gaus S, Zimmerer R, Ziebolz D, Schmalz G, Jiang X. Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Different Immune Signatures in HPV- and HPV + Driven Human Head and Neck Squamous Cell Carcinoma. J Immunol Res. 2022 Sep 16;2022:2079389. doi: 10.1155/2022/2079389. PMID: 36157879; PMCID: PMC9507777.
6. Jie L, Kailong X, Lixin Ma, Yang W*. Single-cell transcriptome analysis of multigrade glioma heterogeneity and immune microenvironment revealed potential prognositc biomarkers. Chinese Academy of Science. Oct.25,2022, 38(10):3790-3808. Doi:10.13345/j.cjb.220481.
7. Liu J, Xu J, Zhang T, Xu K, Bao P, Zhang Z, Xue K, He R, Ma L, Wang Y*. Decoding the Immune Microenvironment of Clear Cell Renal Cell Carcinoma by Single-Cell Profiling to Aid Immunotherapy. Front Immunol. 2022 Jun 24;13:791158. doi: 10.3389/fimmu.2022.791158. PMID: 35812372; PMCID: PMC9263726.
8. Ning W, Acharya A, Sun Z, Ogbuehi AC, Li C, Hua S, Ou Q, Zeng M, Liu X, Deng Y, Haak R, Ziebolz D, Schmalz G, Pelekos G*, Wang Y*, Hu X*. (2021) Immunosuppression genes and distinct immunotypes in Periodontitis. Frontiers in Genetics 12, 648329.
9. Wang Y, He R, Ma L*. (2020) Chracterization of lncRNA-associated ceRNA network to reveal potential prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 8, 266
10. Wang Y, Chen SX, Rao X, Liu Y*. (2020) Modulator-dependent RBPs changes alternative splicing outcomes in kidney cancer. Frontiers in Genetics 11, 265.
11. He R, Wang L, Li J, Ma L*, Wang F*, Wang Y*. (2020) Integrated analysis of a competing endogenous RNA network reveals a prognostic signature in kidney renal papillary cell carcinoma. Frontiers in Cell and Developmental Biology 8, 612924.
12. Hu YH, Wang Y, Wang F, Dong YM, Jiang WL, Wang YP, Zhong X, Ma L. (2021) SPOP negatively regulates Toll-like receptor-induced inflammation by disrupting MyD88 self-association. Cellular & molecular Immunology 18, 1708–1717.
13. Li J#, Wang Y#, Meng X, Liang H. (2018) Modulation of transcriptional activity in brain lower grade glioma by alternative splicing. Peer J. 6, e4686.
六、申请与授权专利
冷冻电镜样品初筛虚拟仿真系统 v1.0 (软著)
CDR-Probe：类抗体结构识别分析工具软件[简称：CDR-Probe]v1.0 (软著)
七、荣誉及奖励
2020年湖北省人才计划
